Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ssx9Q6XAS3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ssx9Q6XAS3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms