Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Atp8b3Q6UQ17 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Atp8b3Q6UQ17 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
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Atp8b3Q6UQ17 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Atp8b3Q6UQ17 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Atp8b3Q6UQ17 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Atp8b3Q6UQ17 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Atp8b3Q6UQ17 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp8b3Q6UQ17 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms