Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc9c1Q6UJY2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Slc9c1Q6UJY2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms