Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gja6Q6S5G4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms