Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc148Q6P5U8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc148Q6P5U8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc148Q6P5U8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc148Q6P5U8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc148Q6P5U8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc148Q6P5U8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc148Q6P5U8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc148Q6P5U8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc148Q6P5U8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc148Q6P5U8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc148Q6P5U8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc148Q6P5U8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc148Q6P5U8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc148Q6P5U8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc148Q6P5U8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms