Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Krt40Q6IFX3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Krt40Q6IFX3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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