Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Pkp4Q68FH0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pkp4Q68FH0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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