Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sptbn2Q68FG2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms