Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sbno1Q689Z5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Sbno1Q689Z5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Sbno1Q689Z5 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Sbno1Q689Z5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sbno1Q689Z5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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