Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nlrp4eQ66X19 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nlrp4eQ66X19 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms