Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nlrp9cQ66X01 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nlrp9cQ66X01 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms