Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms