Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sdc3Q64519 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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