Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gja3Q64448 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gja3Q64448 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms