Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc18Q640L5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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