Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CcncQ62447 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcncQ62447 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms