Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nptx1Q62443 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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