Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Hoxa13Q62424 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxa13Q62424 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms