Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr1bQ62267 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr1bQ62267 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms