Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5dQ62240 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5dQ62240 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms