Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Rbm38Q62176 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Rbm38Q62176 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Rbm38Q62176 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Rbm38Q62176 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Rbm38Q62176 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Rbm38Q62176 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Rbm38Q62176 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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Rbm38Q62176 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Rbm38Q62176 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
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