Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Odf1Q61999 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Odf1Q61999 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Odf1Q61999 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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Odf1Q61999 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Odf1Q61999 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Odf1Q61999 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Odf1Q61999 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Odf1Q61999 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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Odf1Q61999 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Odf1Q61999 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Odf1Q61999 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Odf1Q61999 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Odf1Q61999 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Odf1Q61999 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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