Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lama3Q61789 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lama3Q61789 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lama3Q61789 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lama3Q61789 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Lama3Q61789 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lama3Q61789 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Lama3Q61789 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Lama3Q61789 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lama3Q61789 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.1 ms