Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Msi1Q61474 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Msi1Q61474 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms