Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ctnna2Q61301 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms