Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp17laQ61068 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp17laQ61068 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms