Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prdm1Q60636 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms