Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Xrcc1Q60596 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Xrcc1Q60596 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Xrcc1Q60596 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Xrcc1Q60596 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Xrcc1Q60596 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Xrcc1Q60596 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Xrcc1Q60596 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Xrcc1Q60596 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Xrcc1Q60596 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Xrcc1Q60596 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Xrcc1Q60596 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Xrcc1Q60596 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Xrcc1Q60596 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Xrcc1Q60596 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Xrcc1Q60596 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Xrcc1Q60596 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Xrcc1Q60596 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Xrcc1Q60596 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Xrcc1Q60596 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Xrcc1Q60596 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Xrcc1Q60596 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Xrcc1Q60596 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Xrcc1Q60596 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Xrcc1Q60596 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Xrcc1Q60596 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Xrcc1Q60596 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Xrcc1Q60596 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Xrcc1Q60596 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Xrcc1Q60596 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Xrcc1Q60596 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Xrcc1Q60596 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Xrcc1Q60596 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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