Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms