Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tns3Q5SSZ5 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tns3Q5SSZ5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms