Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ndufaf2Q59J78 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufaf2Q59J78 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms