Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CenpjQ569L8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CenpjQ569L8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms