Protein–RNA interactions for Protein: Q505G8

Znf827, Zinc finger protein 827, mousemouse

Predictions only

Length 1,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf827Q505G8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Znf827Q505G8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Znf827Q505G8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Znf827Q505G8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Znf827Q505G8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Znf827Q505G8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Znf827Q505G8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Znf827Q505G8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Znf827Q505G8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Znf827Q505G8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Znf827Q505G8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms