Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Xirp2Q4U4S6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Xirp2Q4U4S6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms