Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnpc3Q3UZ01 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rnpc3Q3UZ01 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms