Protein–RNA interactions for Protein: Q3USW5

Foxred2, FAD-dependent oxidoreductase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxred2Q3USW5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Foxred2Q3USW5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms