Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zyg11bQ3UFS0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zyg11bQ3UFS0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms