Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LbrQ3U9G9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LbrQ3U9G9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms