Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ssbp4Q3U4B1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ssbp4Q3U4B1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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