Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Rnf149Q3U2C5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rnf149Q3U2C5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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