Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0V2

Tradd, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TraddQ3U0V2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TraddQ3U0V2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TraddQ3U0V2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TraddQ3U0V2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TraddQ3U0V2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TraddQ3U0V2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TraddQ3U0V2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TraddQ3U0V2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TraddQ3U0V2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TraddQ3U0V2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TraddQ3U0V2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TraddQ3U0V2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TraddQ3U0V2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TraddQ3U0V2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TraddQ3U0V2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TraddQ3U0V2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms