Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Ccdc136Q3TVA9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc136Q3TVA9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms