Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37744-201ENSMUST00000194616 1590 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc102aQ3TMW1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms