Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc10Q3TLI0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms