Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
H2afvQ3THW5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2afvQ3THW5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms