Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cul4aQ3TCH7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cul4aQ3TCH7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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