Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Chrna5Q2MKA5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Chrna5Q2MKA5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms