Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ptchd1Q14B62 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms