Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpusd2Q149F1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms