Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccdc162pQ0VG85 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc162pQ0VG85 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms